Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabl6Q5U3K5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabl6Q5U3K5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabl6Q5U3K5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabl6Q5U3K5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabl6Q5U3K5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rabl6Q5U3K5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rabl6Q5U3K5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rabl6Q5U3K5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rabl6Q5U3K5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rabl6Q5U3K5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rabl6Q5U3K5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rabl6Q5U3K5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rabl6Q5U3K5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rabl6Q5U3K5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rabl6Q5U3K5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabl6Q5U3K5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms