Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tsr1Q5SWD9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tsr1Q5SWD9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tsr1Q5SWD9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tsr1Q5SWD9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tsr1Q5SWD9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms