Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc42Q5SV66 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc42Q5SV66 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc42Q5SV66 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc42Q5SV66 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc42Q5SV66 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc42Q5SV66 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc42Q5SV66 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc42Q5SV66 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc42Q5SV66 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc42Q5SV66 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc42Q5SV66 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc42Q5SV66 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc42Q5SV66 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc42Q5SV66 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc42Q5SV66 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc42Q5SV66 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc42Q5SV66 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc42Q5SV66 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc42Q5SV66 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc42Q5SV66 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms