Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd40Q5SUE8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd40Q5SUE8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd40Q5SUE8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd40Q5SUE8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd40Q5SUE8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd40Q5SUE8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd40Q5SUE8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd40Q5SUE8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd40Q5SUE8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd40Q5SUE8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd40Q5SUE8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd40Q5SUE8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd40Q5SUE8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ankrd40Q5SUE8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms