Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sco1Q5SUC9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Sco1Q5SUC9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Sco1Q5SUC9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Sco1Q5SUC9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Sco1Q5SUC9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Sco1Q5SUC9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Sco1Q5SUC9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sco1Q5SUC9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms