Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znrf3Q5SSZ7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Znrf3Q5SSZ7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms