Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms