Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap44Q5SSM3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap44Q5SSM3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms