Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TefmQ5SSK3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TefmQ5SSK3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms