Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

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Length 794 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdh12Q5RJH3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdh12Q5RJH3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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