Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc1Q5NCF2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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