Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttf2Q5NC05 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms