Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Taf3Q5HZG4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf3Q5HZG4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms