Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc3Q5DU56 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrc3Q5DU56 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms