Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rtl5Q5DTT4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rtl5Q5DTT4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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