Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CenpjQ569L8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpjQ569L8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms