Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Snx25Q3ZT31 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Snx25Q3ZT31 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx25Q3ZT31 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms