Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam220aQ3ZN08 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam220aQ3ZN08 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms