Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SvipQ3UZP4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SvipQ3UZP4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms