Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV48

Lrrc30, Leucine-rich repeat-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc30Q3UV48 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lrrc30Q3UV48 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc30Q3UV48 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms