Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fchsd2Q3USJ8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fchsd2Q3USJ8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fchsd2Q3USJ8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms