Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vwa5b2Q3UR50 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms