Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Skap2Q3UND0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skap2Q3UND0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms