Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cln5Q3UMW8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cln5Q3UMW8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms