Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnep1r1Q3UJ81 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnep1r1Q3UJ81 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms