Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx27Q3UHD6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx27Q3UHD6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms