Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rsph3aQ3UFY4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rsph3aQ3UFY4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rsph3aQ3UFY4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rsph3aQ3UFY4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rsph3aQ3UFY4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rsph3aQ3UFY4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rsph3aQ3UFY4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rsph3aQ3UFY4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rsph3aQ3UFY4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rsph3aQ3UFY4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms