Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll12Q3UDE2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll12Q3UDE2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll12Q3UDE2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll12Q3UDE2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll12Q3UDE2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll12Q3UDE2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll12Q3UDE2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll12Q3UDE2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll12Q3UDE2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll12Q3UDE2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttll12Q3UDE2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttll12Q3UDE2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttll12Q3UDE2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll12Q3UDE2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll12Q3UDE2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll12Q3UDE2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll12Q3UDE2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll12Q3UDE2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll12Q3UDE2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll12Q3UDE2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll12Q3UDE2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttll12Q3UDE2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms