Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trip13Q3UA06 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip13Q3UA06 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip13Q3UA06 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms