Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam117bQ3U3E2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam117bQ3U3E2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam117bQ3U3E2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam117bQ3U3E2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam117bQ3U3E2 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam117bQ3U3E2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam117bQ3U3E2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam117bQ3U3E2 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam117bQ3U3E2 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam117bQ3U3E2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam117bQ3U3E2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam117bQ3U3E2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam117bQ3U3E2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam117bQ3U3E2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam117bQ3U3E2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam117bQ3U3E2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam117bQ3U3E2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam117bQ3U3E2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms