Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hace1Q3U0D9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hace1Q3U0D9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms