Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR2

Xlr4c, X-linked lymphocyte-regulated 4C, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4cQ3TKR2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xlr4cQ3TKR2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xlr4cQ3TKR2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms