Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms