Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hddc2Q3SXD3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hddc2Q3SXD3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms