Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne9Q1RLL3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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