Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sap25Q1EHW4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sap25Q1EHW4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms