Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf3ip1Q149C2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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