Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK3Q13003 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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