Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtel1Q0VGM9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtel1Q0VGM9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms