Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd12Q0VE29 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Samd12Q0VE29 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms