Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam83bQ0VBM2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam83bQ0VBM2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms