Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Itgb8Q0VBD0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms