Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms