Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc4Q08624 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc4Q08624 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc4Q08624 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxc4Q08624 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms