Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms