Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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