Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col17a1Q07563 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col17a1Q07563 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Col17a1Q07563 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Col17a1Q07563 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col17a1Q07563 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col17a1Q07563 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col17a1Q07563 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col17a1Q07563 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col17a1Q07563 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col17a1Q07563 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col17a1Q07563 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col17a1Q07563 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col17a1Q07563 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Col17a1Q07563 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Col17a1Q07563 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Col17a1Q07563 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col17a1Q07563 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col17a1Q07563 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms