Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NrepQ07475 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms