Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AmbpQ07456 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AmbpQ07456 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms