Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdf3Q07104 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms